История  зоопарка пока не изобилует историческими открытиями и свершениями. Эта история больше похожа на то, как простые люди стали выхаживать раненых и больных домашних и затем и диких животных.

А началось все с того что в летний период 1995 года ( июль) администрация муниципального парка Индустриального района на «Старом базаре» приобрела двух курочек и двух кроликов, которых стали показывать посетителям небольшого зооуголка. В последствии в зооуголке появились пони, знаменитый верблюд  по кличке Чоки, который был любимцем публики ( подарок главы Индустриального района  Г.В.Куликова). В деревянных вольерах поселились лисицы, корсаки, белки. Деревянное строительство осуществлялось в течении 1995- 1997 годов.

Пони катали детвору, а маленький зооуголок стал пристанищем раненых и брошенных животных. В 2001 году в парке поселились яки Миша и Маша которые были куплены в с Шебалино.

15 июня 2005 года  администрация города принимает постановление№ 1716 " О ликвидации МУП "Парк "Лесная сказка". После ликвидации муниципального предприятия зооуголок получает свое второе рождение. Под руководством нового директора парка начинается постепенная реконструкция. Старые деревянные вольеры с обвисшей сеткой рабицей, не имеющие эстетичного вида, меняются на новые современные конструкции.

В 2006 году в зоопарке появляются новые обитатели- американская лама, верблюд, черно-бурые лисы, волк.

2007 год ознаменован новосельем зоопарка такими животными как чешские козы, барсуки.

Предприниматель Дмитрий Ветчинкин дарит зоопарку гималайского медведя Ивана.

В зоопарке регулярно проводятся познавательные мероприятия, конкурсы и викторины.

В 2008 году расширяется видовой состав домашней птицы. На смену обычным курочкам и уткам приходят элитные виды кур, индоутки, индейки.

В 2008 году меняется внешний облик вольеров для верблюда, европейских благородных оленей, пони, овец, и яков.

В этом же году начинает работать программа помощи животным предпринимательским сообществом города и края.  При огромной информационной поддержке газет «Комсомольская правда» и «Вечерний Барнаул» у зоопарка появляются друзья-спонсоры- фирма «Мария-Ра», ОАО «Алейский мясокомбинат», ООО «Алтай-Агрокорм».

В 2009 году завершается реконструкция вольеров для хищников.

В 2010 году впервые в истории у зооуголка появились друзья- спонсоры  которые построили современный и дорогой вольер для гималайский медведей. Это компания  ООО «Жилищная инициатива». В зоопарке города Северск Томской области приобретена самка гималайского медведя. Переезд из старого вольера медведя Ивана оказался трагическим. Иван погиб от сердечной недостаточности. Приехавшая самка по кличке Кроха оказалась одна в огромной вольере.

В этом же году в зоопарке поселились элитные павлины, дальневосточный лесной кот, вислобрюхая вьетнамская свинка и подаренный зоопарку народным художником России Михаилом Будкеевым ослик Яша. Для всех животных были построены новые вольеры.

В июле 2010 года  в связи с увеличивающимся объемом работы в ООО «Парк развлечений и отдыха « Лесная сказка» было принято решение об  образовании отдельного  ООО «Барнаульский зоопарк».

12 августа дата официальной регистрации БАРНАУЛЬСКОГО ЗООПАРКА. 
22 октября открыт счет в отеделении Росбанка.

Директором зоопарка назначен Сергей Викторович Писарев.

16 ноября 2010 года произошло очень важное событие не только в истории зоопарка но и  истории миграции пеликанов(розовых) Сбившись с пути они улетели не на юг, а прилетели к нам. 4 пеликана таким образом поселились в зоопарке вызвав к себе мировой интерес  орнитологов.

В 2011 году зоопарк пополнился новыми животными. К нам прибыли марал, красный волк, канадский волк, нутрии, рысь сибирская, соболь, американская норка, камышовые коты, дальневосточный кот, фуро, ондатры, дикие кабаны, муфлон, дальневосточный леопард.

В этом же году построены вольеры для нутрии, соболей, белок, канадской пумы, дальневосточного леопарда, камышовых котов, снежных лис, сибирских рысей , розовых пеликанов, диких кабанов.